A tapasztalt cseh kereskedő, Josef Vitus Becher (1769-1840) alapította meg a Becherovka márkát. Az "U Troch škovránkov – A három pacsirtánál" nevű üzletében a fűszerekkel és gyarmati árukkal való kereskedés mellett az alkoholos italok gyártásával is előszeretettel foglalkozott. 1794-ben kibérelt egy borlepárló üzemet, és elkezdett kísérletezni a likőrökkel. A családi hagyományoknak megfelelően a közügyekből is kivette a részét, úgy, mint ügyvéd, vagy mint polgármester.

1807 májusában fontos nap következett be a Becherovka márka történetében: „A három pacsirtánál” elkezdték árulni az „English Bitter” nevű italt, amelyet gyógyászati céllal, gyomorbántalmak gyógyítására használtak. A gyógyital hamarosan híressé vált a városban, és az emberek messziről jöttek, hogy megkapják ezt a gyomorproblémákra enyhülést hozó gyógyszert. Ellentétben a közönséges gyógynövényekkel és összetevőkkel, amelyeket súly szerint árultak, Becher itala a gyógynövények és fűszerek varázslatos főzete volt, amely nemcsak a beteg gyomrát, hanem a lelkét is meggyógyította.

2010 körül, kevesebb mint egy év alatt Karlovy Vary Bohatice nevű városrészében új, modern üzem épült, amely a mai kor igényeit is kielégíti. A legmodernebb technológiával felszerelt, költséges csarnok lehetővé tette, hogy a finom likőr gyártását a városközpontból kihelyezzék, és a kapacitást akár 40%-kal megnöveljék. 2010 szeptemberében hagyták el a gyárat az első palackok, és a Becherovka több mint 35 országra, köztük az USA-ra is kiterjesztette exportját. A vállalat ma a Pernod Ricard tulajdonában van.

A Becherovka 20 féle gyógynövényből és fűszerből készül, amelyeket messzi földrészekről, valamint Karlovy Vary környékéről szereznek be. A pontos receptet generációról generációra szálló titok védi. A világon mindössze két ember ismeri a pontos receptet. Mivel a Becherovka készítésének az a módja, hogy a keveréket mindig az alapoktól kell kikeverni, így a végtermékeknél gyakran előfordulhatnak kisebb eltérések. Magának az italnak az integritása azonban mindig megmarad. A gyógynövénykeveréket a tartályokba helyezés után leöntik alkohollal. Itt zajlik a digerálásnak nevezett folyamat, amelynek során a gyógynövényeket melegítéssel macerálják, majd hagyják kihűlni. A frissen keletkezett erjedési vagy erjesztési terméket a keverőedényekbe vezetik át, ahol alkoholt, cukoroldatot, vizet és egyéb összetevőket adnak hozzá. Az így kapott félkész terméket ezután a tartályokban hagyják érlelődni akár több hétig is. Az érlelt sűrítményt összekeverik az utolsó összetevőkkel, majd kettős szűrésen megy keresztül a nedü, ami a Becherovka tisztaságát adja. A terméket ezután lehűtik, hogy elnyerje végleges formáját. Palackozás előtt a Becherovka laboratóriumi vizsgálaton esik át. A megjelenés, az aroma és a címke ellenőrzése után már nem áll semmi az utolsó lépés útjában: értékesítés a világ minden pontján.